Fue un pionero. Un osado al incorporar las estrategias de defensa y seguridad nacional al análisis de la política exterior de Estados Unidos hacia América Latina. Su propuesta obligó a repensar la geopolítica regional. De ahí que sus investigaciones abriesen camino. Sus estudios dejan huellas. Muestran los vínculos existentes entre las ciencias sociales, las acciones militares, el control de las materias primas y los proyectos imperiales de dominación que acompañan el intervencionismo estadunidense. 

John Saxe-Fernández desnudó la arquitectura, el armazón ideológicopolítico sobre el cual el establishment estadunidense levanta su sueño de control imperial. No puso adjetivos, investigó, proporcionando datos, elementos para apuntalar un pensamiento emancipador. Lo hizo siempre. No necesitó del insulto ni la descalificación. Sus argumentos fueron el rigor teórico y la contundencia de los hechos expuestos. No dio lugar a dobleces ni manipulaciones. Se ganó el respeto y reconocimiento en el campo académico y la lucha teórica. El mejor ejemplo: la labor divulgativa en La Jornada. Sus columnas de opinión son joyas para pensar nuestra América desde un compromiso con las luchas antimperialistas. 

En su trayectoria vital, entre otras, fue testigo de la revolución cubana, la invasión a República Dominicana, el triunfo de la Unidad Popular, los golpes de Estado, la revolución sandinista, la invasión a Panamá, la caída del muro de Berlín, el alzamiento zapatista, la detención de........

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